建设加氢站投资1200-1800万元，单站平均投资规模1500万元。其中，设备采购费用占总投资的60-80%，主要是核心零部件仍依赖进口。但随着工业化的快速推进，未来三年核心零部件有望实现国产化，设备采购成本有望降低30%。
以外供氧高压氢气加氢站为例，需要采购压缩机、储氢瓶、加氢冷却系统等控制系统。还包括土地费用、设计施工费用、设备安装费用等。另据报道，单个氢气站年运营成本为200万元，目前大部分处于亏损状态。主要原因在于制氢成本高。以1000 Nm /h规模的PEM电解槽制氢为例，制氢成本每公斤近40元。
国家能源集团、中石化、中石油等大型企业都参与了加氢站的建设。根据国家规划，2025年国内加氢站数量要达到1000座。截至2021年底，已建成207座加氢站，广东省以36座位居第一，河北省和山东省各21座并列第二。据不完全统计，五大示范城市群涉及13个省市的40个城市。到2025年，各城市设定的氢燃料电池汽车总量达到89840辆，规划的加氢站超过822座。加氢站建设总规模将超过125亿元。
